Protein–RNA interactions for Protein: P06796

Csn3, Kappa-casein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn3P06796 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csn3P06796 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csn3P06796 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csn3P06796 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csn3P06796 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csn3P06796 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csn3P06796 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csn3P06796 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csn3P06796 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csn3P06796 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn3P06796 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn3P06796 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn3P06796 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csn3P06796 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn3P06796 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn3P06796 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csn3P06796 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn3P06796 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn3P06796 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn3P06796 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn3P06796 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csn3P06796 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms