Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06330 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06330 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06330 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06330 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06330 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06330 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06330 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06330 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06330 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06330 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06330 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06330 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06330 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06330 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06330 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06330 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06330 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06330 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06330 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06330 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06330 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06330 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06330 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06330 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06330 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06330 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06330 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06330 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06330 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06330 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06330 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06330 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06330 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06330 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06330 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06330 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06330 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06330 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06330 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06330 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06330 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06330 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06330 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06330 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06330 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06330 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06330 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06330 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06330 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06330 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06330 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06330 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06330 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06330 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06330 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06330 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06330 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06330 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06330 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06330 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06330 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06330 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06330 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P06330 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06330 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06330 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06330 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06330 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06330 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06330 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06330 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06330 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06330 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P06330 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06330 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06330 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06330 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06330 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06330 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06330 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06330 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06330 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06330 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06330 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06330 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P06330 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06330 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06330 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06330 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06330 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06330 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06330 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06330 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06330 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P06330 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06330 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06330 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06330 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06330 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms