Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lancl1O89112 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lancl1O89112 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lancl1O89112 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lancl1O89112 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lancl1O89112 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lancl1O89112 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lancl1O89112 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lancl1O89112 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lancl1O89112 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lancl1O89112 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lancl1O89112 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lancl1O89112 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms