Protein–RNA interactions for Protein: O89051

Itm2b, Integral membrane protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2bO89051 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itm2bO89051 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itm2bO89051 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Itm2bO89051 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itm2bO89051 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itm2bO89051 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Itm2bO89051 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itm2bO89051 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itm2bO89051 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itm2bO89051 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itm2bO89051 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itm2bO89051 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itm2bO89051 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itm2bO89051 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Itm2bO89051 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itm2bO89051 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Itm2bO89051 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itm2bO89051 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itm2bO89051 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itm2bO89051 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itm2bO89051 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itm2bO89051 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itm2bO89051 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Itm2bO89051 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itm2bO89051 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itm2bO89051 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itm2bO89051 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itm2bO89051 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Itm2bO89051 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itm2bO89051 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Itm2bO89051 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Itm2bO89051 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Itm2bO89051 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itm2bO89051 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itm2bO89051 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itm2bO89051 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itm2bO89051 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itm2bO89051 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itm2bO89051 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Itm2bO89051 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Itm2bO89051 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itm2bO89051 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itm2bO89051 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itm2bO89051 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itm2bO89051 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itm2bO89051 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itm2bO89051 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itm2bO89051 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Itm2bO89051 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itm2bO89051 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itm2bO89051 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itm2bO89051 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itm2bO89051 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itm2bO89051 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itm2bO89051 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itm2bO89051 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itm2bO89051 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itm2bO89051 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itm2bO89051 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms