Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nck2O55033 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nck2O55033 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nck2O55033 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nck2O55033 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nck2O55033 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nck2O55033 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nck2O55033 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nck2O55033 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nck2O55033 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nck2O55033 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nck2O55033 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nck2O55033 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nck2O55033 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nck2O55033 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms