Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cops5O35864 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cops5O35864 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cops5O35864 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cops5O35864 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cops5O35864 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cops5O35864 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms