Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Foxd2O35392 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Foxd2O35392 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms