Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kpna4O35343 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kpna4O35343 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kpna4O35343 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kpna4O35343 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kpna4O35343 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kpna4O35343 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kpna4O35343 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kpna4O35343 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kpna4O35343 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kpna4O35343 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kpna4O35343 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kpna4O35343 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kpna4O35343 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kpna4O35343 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kpna4O35343 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kpna4O35343 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kpna4O35343 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kpna4O35343 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kpna4O35343 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kpna4O35343 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kpna4O35343 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna4O35343 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna4O35343 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna4O35343 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna4O35343 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna4O35343 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna4O35343 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kpna4O35343 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kpna4O35343 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kpna4O35343 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kpna4O35343 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kpna4O35343 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kpna4O35343 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kpna4O35343 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kpna4O35343 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kpna4O35343 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kpna4O35343 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kpna4O35343 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kpna4O35343 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kpna4O35343 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kpna4O35343 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.3 ms