Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn2O08529 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn2O08529 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn2O08529 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn2O08529 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn2O08529 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn2O08529 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn2O08529 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Capn2O08529 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Capn2O08529 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn2O08529 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn2O08529 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms