Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms