Protein–RNA interactions for Protein: F6S200

Plekhg1, Pleckstrin homology domain-containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhg1F6S200 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Plekhg1F6S200 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Plekhg1F6S200 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Plekhg1F6S200 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Plekhg1F6S200 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Plekhg1F6S200 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Plekhg1F6S200 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plekhg1F6S200 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plekhg1F6S200 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plekhg1F6S200 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Plekhg1F6S200 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plekhg1F6S200 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Plekhg1F6S200 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Plekhg1F6S200 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Plekhg1F6S200 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Plekhg1F6S200 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Plekhg1F6S200 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Plekhg1F6S200 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms