Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp31E9Q6Y8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp31E9Q6Y8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms