Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms