Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cngb1E1AZ71 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cngb1E1AZ71 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cngb1E1AZ71 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cngb1E1AZ71 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cngb1E1AZ71 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cngb1E1AZ71 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cngb1E1AZ71 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cngb1E1AZ71 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cngb1E1AZ71 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Cngb1E1AZ71 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Cngb1E1AZ71 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cngb1E1AZ71 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cngb1E1AZ71 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cngb1E1AZ71 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms