Protein–RNA interactions for Protein: A6X8I0

Gm1993, Predicted gene 1993, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1993A6X8I0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1993A6X8I0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1993A6X8I0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1993A6X8I0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1993A6X8I0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1993A6X8I0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1993A6X8I0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1993A6X8I0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1993A6X8I0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1993A6X8I0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1993A6X8I0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1993A6X8I0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1993A6X8I0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1993A6X8I0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1993A6X8I0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1993A6X8I0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1993A6X8I0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm1993A6X8I0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm1993A6X8I0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm1993A6X8I0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm1993A6X8I0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms