Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms