Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl41A2AUC9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms