Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef17A2ASJ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms