Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc183A2AJB1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc183A2AJB1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms