Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin3aA2AIR5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin3aA2AIR5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin3aA2AIR5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin3aA2AIR5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin3aA2AIR5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin3aA2AIR5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin3aA2AIR5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin3aA2AIR5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin3aA2AIR5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin3aA2AIR5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin3aA2AIR5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin3aA2AIR5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin3aA2AIR5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin3aA2AIR5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin3aA2AIR5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin3aA2AIR5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin3aA2AIR5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin3aA2AIR5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin3aA2AIR5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms