Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
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