Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms