Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF1P10914 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF1P10914 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IRF1P10914 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
IRF1P10914 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF1P10914 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF1P10914 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
IRF1P10914 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF1P10914 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF1P10914 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF1P10914 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF1P10914 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms