Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Stx18Q8VDS8 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Stx18Q8VDS8 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Stx18Q8VDS8 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Stx18Q8VDS8 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Stx18Q8VDS8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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