Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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