Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms