Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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