Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hoxa10P31310 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hoxa10P31310 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms