Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NelfeP19426 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NelfeP19426 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms