Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nicn1Q9CQM0 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms