Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms