Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Epb41P48193 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Epb41P48193 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Epb41P48193 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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