Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm4340L7N2C4 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4340L7N2C4 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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