Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms