Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Msrb1Q9JLC3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Msrb1Q9JLC3 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Msrb1Q9JLC3 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Msrb1Q9JLC3 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Msrb1Q9JLC3 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Msrb1Q9JLC3 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Msrb1Q9JLC3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Msrb1Q9JLC3 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms