Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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PtprdQ64487 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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