Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RxraP28700 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms