Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms