Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTRA4P83105 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms