Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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