Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL3O43909 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms