Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms