Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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