Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms