Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbbP0CG49 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms