Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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Gm20828J3KMI7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Gm20828J3KMI7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Gm20828J3KMI7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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