Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ergic3Q9CQE7 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic3Q9CQE7 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms