Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms