Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprdQ64487 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms