Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms